Im Zuge der Neukonzeption des zentralen Thingplatzes im Jahr 1998 wurde auch der Zentrale Omnibusbahnhof geschaffen. Dieser dient nicht nur als Dreh- und Angelpunkt für Schüler, die täglich die Schulwege beginnen und beenden, sondern auch als Knotenpunkt für regelmäßige Busverbindungen in die umliegenden Städte und Gemeinden der Region.
Der ZOB Eggebek dient als Anfangs- und Endhaltestelle für verschiedene Buslinien der Verkehrsbetriebe Schleswig-Flensburg GmbH.
Buslinie 866: Diese Linie ist eine kreisförmige Route mit 26 Haltestellen, die vom ZOB Eggebek abfährt. Der Betrieb beginnt an Wochentagen um 06:30 Uhr und endet freitags um 13:25 Uhr. Die gesamte Fahrtdauer für die Route beträgt etwa 50 Minuten.
Buslinie 860: Diese Linie fährt von Flensburg ZOB nach Eggebek ZOB und hat 32 Haltestellen. Der Betrieb beginnt täglich um 06:30 Uhr und endet sonntags um 17:30 Uhr. Auch hier beträgt die Fahrtdauer für die gesamte Route ungefähr 50 Minuten.